故事從傳說中的誇克族與暗黑族開始延伸。善良與邪惡形成兩勢力對抗，加入「萌學園」裏的萌騎士團結在一起保護結界。萌學園裏的魔法預言書蘊藏著什麼 天大的秘密？奈亞公主及憂傷艾瑞克純純的情愫正在發酵，誤闖萌學園的堅尼，會為萌騎士團帶來什麼衝擊？顛覆你對魔幻世界的想像力，一起探索萌學園體驗奇幻 旅程。

《萌學園2聖戰再起》從2010年12月18日起，每週六晚播送一集,本站沒有，其他地方更沒有！

一個神奇的魔法世界－萌學園，為對抗即將到來的闇黑力量，傳說中的萌騎士團將再次聚首，為守護掌握關鍵力量的奈亞公主；一對看似再平凡不過的寶貝兄弟—藍寶與堅尼， 就這樣誤打誤撞的踏上未知的旅途，他們究竟會是萌學園期待的轉機，還是危機？

一項神秘而不可窺視的『萌學園』今年竟然公開招生了，這真是天大的消息啊，藍寶和堅尼，這兩個好友兼換帖的兄弟竟然神奇的被招喚入學，兩個人為了豐厚獎學金跟一堆誘人的好處滿懷期待地往『萌學園』出發…

一座平凡的電話亭竟然是『萌學園』的新生入學口…

萌學園萌騎士團，超強組合!! 百年大戲，萌學園3魔法號令.